Le Centre Pasteur Cameroun recrute un(e) Stagiaire de recherche en Bio-informatique et Génomique

Le Centre Pasteur Cameroun recrute un(e) Stagiaire de recherche en Bio-informatique et Génomique

 

Le Centre Pasteur du Cameroun (CPC), dans le but de poursuivre sa vocation de formation et d'encadrement, est à la recherche d'un(e) Stagiaire de recherche en Bio-informatique et Génomique, actuellement en préparation d'un diplôme de Master II. Il s'agit d'un stage de recherche académique s'étalant sur une période de six à huit mois. La personne sélectionnée intégrera la plateforme génomique du service de virologie à Yaoundé. Sous la supervision directe du Dr Delia Doreen DJUICY, elle prendra part aux initiatives de recherche axées sur le virus MPOX.

Missions du poste:

  • Élaborer, perfectionner et automatiser des pipelines bio-informatiques pour le traitement des données issues du séquençage à haut débit (technologies Oxford Nanopore et Illumina).
  • Mettre en application ces analyses pour la surveillance génomique et la classification phylogénétique des agents infectieux émergents (particulièrement le virus MPOX et d'autres virus d'importance en santé publique).

Profil recherché:

  • Être un(e) étudiant(e) inscrit(e) en deuxième année de Master (Master II) dans l'un des domaines suivants: informatique, science des données, bio-mathématiques, bio-statistiques, biotechnologies, biologie moléculaire ou biochimie.
  • Prouver de solides capacités en programmation.

Compétences requises et souhaitées:

  • Maîtriser impérativement l'environnement Unix/Linux et l'utilisation de la ligne de commande.
  • Disposer de très bonnes notions en programmation (R, Python ou Shell/Bash).
  • Démontrer un grand attrait pour la virologie, la santé publique et la biologie moléculaire.
  • Faire preuve d'une grande rigueur scientifique, d'indépendance, d'un bon esprit analytique et d'une aptitude à évoluer dans un groupe pluridisciplinaire (épidémiologistes, biologistes, cliniciens).
  • Détenir d'excellentes capacités en rédaction scientifique et bien comprendre l'anglais technique.
  • Une connaissance préalable des outils d'analyse bio-informatique (FastQC, BWA, Samtools, BLAST) ou des gestionnaires de flux de travail (Nextflow, Snakemake) constituera un véritable atout.

Composition du dossier:
L'ensemble des pièces doit être regroupé en un seul fichier PDF comprenant:

  • Une lettre de motivation.
  • Un CV à jour renseignant les contacts de deux référents académiques, les logiciels informatiques maîtrisés, ainsi que d'éventuels liens pointant vers des profils GitHub ou des projets.
  • Les relevés de notes (Licence, Master I et le premier semestre du Master II).
  • Une lettre de recommandation émanant du directeur de mémoire académique, attestant de son engagement à co-diriger ledit mémoire.

Modalités de candidature:
Les dossiers physiques doivent être transmis sous enveloppe fermée au secrétariat du directeur général du Centre pasteur du Cameroun (CPC) situé à Yaoundé, au plus tard le 30 octobre 2026. L'enveloppe devra impérativement porter la mention: «Stage académique de recherche en Bio-informatique et Génomique». Les candidat(e)s choisi(e)s devront être prêts à démarrer leur formation dès le 1er novembre 2026.

NB: selon les résultats obtenus durant ce stage, une opportunité de poursuite en thèse de doctorat pourra être envisagée.

Pour lire l'appel à candidatures détaillé, veuillez consulter ce lien: https://pasteur-yaounde.org/wp-content/uploads/2026/10/Recherche-dun-etudiant-MasterII-CPC.pdf

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